RM8375是美國NIST推出的微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品,核心用途為微生物全基因組測序的驗證、優(yōu)化、過程評估及性能檢測,可精準(zhǔn)評估高通量測序方法的可靠性,為測序?qū)嶒炋峁?biāo)準(zhǔn)化參照。該標(biāo)準(zhǔn)品由4個獨立小瓶組成,每瓶含一種特異性微生物基因組DNA樣本,分別為MG-001鼠傷寒沙門氏菌LT2、MG-002金黃色葡萄球菌、MG-003銅綠假單胞菌及MG-004產(chǎn)孢梭菌,均從純細(xì)胞培養(yǎng)物中提取,純度經(jīng)嚴(yán)格檢測,完l全適配測序相關(guān)實驗需求。
該RM8375 微生物基因組DNA標(biāo)準(zhǔn)品不用于評估DNA提取等前分析步驟,主要針對測序文庫制備、測序儀器性能、堿基識別算法及后續(xù)生物信息學(xué)分析環(huán)節(jié)進(jìn)行驗證,不適用于菌株鑒定、系統(tǒng)發(fā)育分析等其他生物信息學(xué)步驟評估。其基因組序列信息可在NCBI序列讀取檔案(SRA)中獲取,對應(yīng)生物樣本編號明確,便于實驗對照與結(jié)果追溯,且序列會隨測序技術(shù)發(fā)展持續(xù)更新優(yōu)化。
儲存方面,長期需在-20℃黑暗環(huán)境下保存,短期(8周內(nèi))可置于4℃黑暗環(huán)境,運輸時配備冷凍包裝,無需全程冷凍。使用時建議用于變異調(diào)用準(zhǔn)確性評估,不推薦用于基因組組裝,且需手動檢查高堿基調(diào)用錯誤率區(qū)域的對齊讀數(shù),確保實驗結(jié)果精準(zhǔn)。該標(biāo)準(zhǔn)品僅用于科研用途,操作時需按CDC及NIH建議,作為生物安全1級材料處理,規(guī)避潛在風(fēng)險。
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